在学理上,主要是研究对象和方法不同；在学科建制上,二者彼此独立,界限很清楚,不存在谁属于谁的问题；在研究具体历史问题时,研究者往往要综合运用二者的资料,有时甚至难以分割（例如古文字学）.
研究对象：历史学研究的是史料,最基本的史料就是文献,亦即文字信息.所以文字发明之前的历史和未被文字记录的历史,自然是历史学研究的短板.考古学研究的是实物,是人类活动遗留下来的有形的、能观测到的东西,包括遗迹、人工遗物和自然遗物.它的特点也很明显,就是绝大多数遗存本身没有文字,考古材料不能自己说话,只能被人代言；而且并非所有的人类活动都能产生有形的遗存,历史上的语言、哲学概念和信仰体系等很可能未留下任何直接证据就消失了.
研究方法：研究对象的性质决定了考古学和历史学研究方法差异极大,即使是研究同一领域的问题 ,在实际工作中也基本是分工合作的状态,很少有人能兼通两者.考古学获取资料的基本途径是田野考古调查和发掘,基本方法是地层学、类型学、埋藏学、民族考古学和实验考古学,还有五花八门的和自然科学相结合的方法可以统称为科技考古.历史学不太容易概括出特别的方法,是所谓“史无定法”,但是最基本还是用来处理文献的,如音韵、训诂、版本、辨伪、考据,稍为特别的比如比较方法、计量方法、心理分析法等等,当然也有异数,比如强调田野工作的历史人类学、口传史学等等,在这里“史料”的概念就不局限于书写的文字,在理论和历史哲学方面则较考古学发达,流派也多. 在学理上,主要是研究对象和方法不同；在学科建制上,二者彼此独立,界限很清楚,不存在谁属于谁的问题；在研究具体历史问题时,研究者往往要综合运用二者的资料,有时甚至难以分割（例如古文字学）.
研究对象：历史学研究的是史料,最基本的史料就是文献,亦即文字信息.所以文字发明之前的历史和未被文字记录的历史,自然是历史学研究的短板.考古学研究的是实物,是人类活动遗留下来的有形的、能观测到的东西,包括遗迹、人工遗物和自然遗物.它的特点也很明显,就是绝大多数遗存本身没有文字,考古材料不能自己说话,只能被人代言；而且并非所有的人类活动都能产生有形的遗存,历史上的语言、哲学概念和信仰体系等很可能未留下任何直接证据就消失了.
研究方法：研究对象的性质决定了考古学和历史学研究方法差异极大,即使是研究同一领域的问题 ,在实际工作中也基本是分工合作的状态,很少有人能兼通两者.考古学获取资料的基本途径是田野考古调查和发掘,基本方法是地层学、类型学、埋藏学、民族考古学和实验考古学,还有五花八门的和自然科学相结合的方法可以统称为科技考古.历史学不太容易概括出特别的方法,是所谓“史无定法”,但是最基本还是用来处理文献的,如音韵、训诂、版本、辨伪、考据,稍为特别的比如比较方法、计量方法、心理分析法等等,当然也有异数,比如强调田野工作的历史人类学、口传史学等等,在这里“史料”的概念就不局限于书写的文字,在理论和历史哲学方面则较考古学发达,流派也多.