①摘去棉花的顶芽，解除顶端优势，促进侧芽生长成枝条，促进产量的提高，属于激素调节；
②给糖尿病患者注射胰岛素，降低血糖浓度，治疗糖尿病，属于激素调节；
③在未成熟的香蕉上喷洒少量低浓度乙烯，促进其尽快成熟，属于激素调节；
④马戏团训练小狗表演杂技，需要条件刺激，属于神经调节中的条件反射．
所以依据其利用的生物学原理在本质上的区别进行分类，最合理的是①②③激素调节与④神经调节．
故选：D． ①摘去棉花的顶芽，解除顶端优势，促进侧芽生长成枝条，促进产量的提高，属于激素调节；
②给糖尿病患者注射胰岛素，降低血糖浓度，治疗糖尿病，属于激素调节；
③在未成熟的香蕉上喷洒少量低浓度乙烯，促进其尽快成熟，属于激素调节；
④马戏团训练小狗表演杂技，需要条件刺激，属于神经调节中的条件反射．
所以依据其利用的生物学原理在本质上的区别进行分类，最合理的是①②③激素调节与④神经调节．
故选：D．