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自然界的水可分为地下水和地面水,除了地下深层水外,如湖泊,河流,海洋等各种地面水中都存在着各种各样的微生物.但它们所含的微生物种类,数量和分布都不相同.
其中有些是“土生土长”的,例如自养菌中的硫磺细菌,硝化细菌,铁细菌,光合细菌等.异养菌中的假单胞杆菌,放线菌,真菌,原生动物及藻类.在水生细菌中革兰氏阴性杆菌最多（占95％）,阳性菌占4％,而球菌只占1％.
另一些水生细菌是外来的,它们来自土壤,空气,垃圾,工厂废物或城市下水道污水.来自前两者的微生物一般都是腐生性的,而来自下水道的微生物中,
自然界的水可分为地下水和地面水,除了地下深层水外,如湖泊,河流,海洋等各种地面水中都存在着各种各样的微生物.但它们所含的微生物种类,数量和分布都不相同.
其中有些是“土生土长”的,例如自养菌中的硫磺细菌,硝化细菌,铁细菌,光合细菌等.异养菌中的假单胞杆菌,放线菌,真菌,原生动物及藻类.在水生细菌中革兰氏阴性杆菌最多（占95％）,阳性菌占4％,而球菌只占1％.
另一些水生细菌是外来的,它们来自土壤,空气,垃圾,工厂废物或城市下水道污水.来自前两者的微生物一般都是腐生性的,而来自下水道的微生物中,