①卡尔文追踪检测¹⁴CO₂在小球藻光合作用中转化成有机物的途径，发现卡尔文循环，利用了同位素标记法； 
②沃林和克里克根据DNA衍谢图谱、通过计算和模型建构，发现了DNA双螺旋结构，利用了构建物理模型的方法； 
③林德曼对赛达伯格湖的能量流动进行定量分析，发现能量传递效率约为10～20%，首先进行定量分析，然后构建了数学模型；
④鲁宾和卡门利用¹⁸O分别标记H₂O和CO₂，发现只有供给H₂¹⁸的小球藻释放¹⁸O₂，证实光合作用中有氧气来自于水，利用了同位素标记法；
⑤赫尔希和蔡斯用³²P和³⁵S分别标记的T₂噬菌体，分别侵染在肠杆菌，搅拌离心后检测放射性的分布，发现DNA是遗传物质，利用了同位素标记法； 
⑥斯他林和贝利斯将狗的小肠黏膜与稀盐酸混合磨碎，制成提取液，注入狗的静脉中，发现了胰液分泌的激素调节，利用了动物激素研究的注射法． 
虽然①④⑤都用了同位素标记法，但不同的是④和⑤都有对比的对象，④用¹⁸O分别标记H₂O和CO₂，可得H₂¹⁸O和CO₂，H₂O和C¹⁸O₂，这两组不同的标记物可以用来对比得知光合作用中有氧气是来自于水而不是二氧化碳．⑤用³²P和³⁵S分别标记的T₂噬菌体的DNA和蛋白质，而大肠杆菌本身有³¹P和³²S，所以同样可以进行对比，验证DNA是遗传物质． 
故选：C． ①卡尔文追踪检测¹⁴CO₂在小球藻光合作用中转化成有机物的途径，发现卡尔文循环，利用了同位素标记法； 
②沃林和克里克根据DNA衍谢图谱、通过计算和模型建构，发现了DNA双螺旋结构，利用了构建物理模型的方法； 
③林德曼对赛达伯格湖的能量流动进行定量分析，发现能量传递效率约为10～20%，首先进行定量分析，然后构建了数学模型；
④鲁宾和卡门利用¹⁸O分别标记H₂O和CO₂，发现只有供给H₂¹⁸的小球藻释放¹⁸O₂，证实光合作用中有氧气来自于水，利用了同位素标记法；
⑤赫尔希和蔡斯用³²P和³⁵S分别标记的T₂噬菌体，分别侵染在肠杆菌，搅拌离心后检测放射性的分布，发现DNA是遗传物质，利用了同位素标记法； 
⑥斯他林和贝利斯将狗的小肠黏膜与稀盐酸混合磨碎，制成提取液，注入狗的静脉中，发现了胰液分泌的激素调节，利用了动物激素研究的注射法． 
虽然①④⑤都用了同位素标记法，但不同的是④和⑤都有对比的对象，④用¹⁸O分别标记H₂O和CO₂，可得H₂¹⁸O和CO₂，H₂O和C¹⁸O₂，这两组不同的标记物可以用来对比得知光合作用中有氧气是来自于水而不是二氧化碳．⑤用³²P和³⁵S分别标记的T₂噬菌体的DNA和蛋白质，而大肠杆菌本身有³¹P和³²S，所以同样可以进行对比，验证DNA是遗传物质． 
故选：C．