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依据题干“翰林文人陪君王读书研学的内廷场所”得知，其时南书房还不是最高政务机关，故A项错误．
依据题干“非上所亲言者不得入”得知，能否进入南书房主要取决于皇帝的信任程度，故B项错误．
因南书房随奉“撰述谕旨”而“权势日崇”，逐渐成为政府决策中心，故C项正确．
专制主义中央集权达到顶峰的标志是军机处的设立，故D项错误．
故选C．
依据题干“翰林文人陪君王读书研学的内廷场所”得知，其时南书房还不是最高政务机关，故A项错误．
依据题干“非上所亲言者不得入”得知，能否进入南书房主要取决于皇帝的信任程度，故B项错误．
因南书房随奉“撰述谕旨”而“权势日崇”，逐渐成为政府决策中心，故C项正确．
专制主义中央集权达到顶峰的标志是军机处的设立，故D项错误．
故选C．