（1）①验证水果电池电压与水果种类关系时，应控制深度和间距相同，让种类不同，即选择2，5；
②验证水果电池电压与两电极间距离关系时，应控制水果种类和深度相同，让间距不同，即选择4，5；
③验证水果电池电压与两电极插入水果的深度关系时，应控制水果种类和间距相同，让深度不同，即选择1，3；
（2）此实验用到的物理方法是控制变量法．
故答案为：（1）2、5；4、5；1、3；（2）控制变量法． （1）①验证水果电池电压与水果种类关系时，应控制深度和间距相同，让种类不同，即选择2，5；
②验证水果电池电压与两电极间距离关系时，应控制水果种类和深度相同，让间距不同，即选择4，5；
③验证水果电池电压与两电极插入水果的深度关系时，应控制水果种类和间距相同，让深度不同，即选择1，3；
（2）此实验用到的物理方法是控制变量法．
故答案为：（1）2、5；4、5；1、3；（2）控制变量法．