A、比较是指根据一定的标准，把彼此有某种联系的事物加以对照，确定它们的相同和不同之处，A正确；
B、比较法是指根据一定的标准，把彼此有某种联系的事物加以对照，确定它们的相同和不同之处，并不是可以确定任何事物的相同点和不同点，B错误；
C、对不同生物种类的形态结构进行比较，可以推断它们之间的亲缘关系，C正确；
D、通过对各个事物特征的比较，可以把握事物之间的内在联系，认识事物的本质，D正确．
故选：B． A、比较是指根据一定的标准，把彼此有某种联系的事物加以对照，确定它们的相同和不同之处，A正确；
B、比较法是指根据一定的标准，把彼此有某种联系的事物加以对照，确定它们的相同和不同之处，并不是可以确定任何事物的相同点和不同点，B错误；
C、对不同生物种类的形态结构进行比较，可以推断它们之间的亲缘关系，C正确；
D、通过对各个事物特征的比较，可以把握事物之间的内在联系，认识事物的本质，D正确．
故选：B．