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计划进行人肠道微生物群落分类,很多样本间比较,solexa和罗氏454两个高通量测序方法,哪个更好?谢谢!有经验的高手请指点我一下.solexa通量高但读长太短,且单个序列准确度低,罗氏454读长很长,可以满足要求,但是通量比solexa小,怎么取舍呢?

2019-05-04

计划进行人肠道微生物群落分类,很多样本间比较,solexa和罗氏454两个高通量测序方法,哪个更好?谢谢!有经验的高手请指点我一下.solexa通量高但读长太短,且单个序列准确度低,罗氏454读长很长,可以满足要求,但是通量比solexa小,怎么取舍呢?
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一般做肠道微生物群落分类是通过扩增细菌16s rDNA某个区来测序,PCR产物长度大都超过200bp.454的平均长度可以测到400bp,选454是较好的方法. 一般做肠道微生物群落分类是通过扩增细菌16s rDNA某个区来测序,PCR产物长度大都超过200bp.454的平均长度可以测到400bp,选454是较好的方法.
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