A、探究不同类型土壤中小动物丰富度的实验，取样器大小是无关变量，使用不同的取样器会得到相同的结论，A正确；
B、DNA不溶于酒精溶液，而细胞中的蛋白质溶于酒精溶液，利用这一原理，可以将DNA与蛋白质进一步分离，B错误；
C、估测土壤浸出液中的细菌数量，可采用稀释涂布平板法，C正确；
D、用纸层析法分离叶绿体中色素的结果中，黄绿色色带距离点样处最近，表明叶绿素b在层析液中的溶解度最小，D错误．
故选：AC． A、探究不同类型土壤中小动物丰富度的实验，取样器大小是无关变量，使用不同的取样器会得到相同的结论，A正确；
B、DNA不溶于酒精溶液，而细胞中的蛋白质溶于酒精溶液，利用这一原理，可以将DNA与蛋白质进一步分离，B错误；
C、估测土壤浸出液中的细菌数量，可采用稀释涂布平板法，C正确；
D、用纸层析法分离叶绿体中色素的结果中，黄绿色色带距离点样处最近，表明叶绿素b在层析液中的溶解度最小，D错误．
故选：AC．