（1）人体器官移植面临的主要问题是供体器官不足和兔疫排斥等．胚胎干细胞来源于早期胚胎或原始性腺，也可以通过核移植技术得到重组细胞后再进行相应处理获得．
（2）为了防止小型猪的器官替代人体器官进行移植时发生免疫排斥反应，科学家正试图利用基因工程对小型猪的器官进行改造，在改造中导入小型猪基因组中的一些调节因子属于基因工程中的目的基因，作用是抑制小型猪器官表面抗原的表达．
（3）蛋白质工程是在基因工程基础上延伸出来的第二代基因工程，其过程是：预期蛋白质功能→设计预期的蛋白质结构→推测应有的氨基酸序列→找到相对应的核苷酸序列．
（4）一般来说，生态工程的主要任务是对已被破坏的生态环境（或受损的生态系统）进行修复，对造成环境污染和破坏的生产方式进行改善，并提高生态系统的生产力．
故答案为：
（1）供体器官不足    早期胚胎     核移植
（2）目的基因      抑制小型猪器官表面抗原的表达
（3）功能   结构   氨基酸
（4）生态环境（或受损的生态系统）      生产方式 （1）人体器官移植面临的主要问题是供体器官不足和兔疫排斥等．胚胎干细胞来源于早期胚胎或原始性腺，也可以通过核移植技术得到重组细胞后再进行相应处理获得．
（2）为了防止小型猪的器官替代人体器官进行移植时发生免疫排斥反应，科学家正试图利用基因工程对小型猪的器官进行改造，在改造中导入小型猪基因组中的一些调节因子属于基因工程中的目的基因，作用是抑制小型猪器官表面抗原的表达．
（3）蛋白质工程是在基因工程基础上延伸出来的第二代基因工程，其过程是：预期蛋白质功能→设计预期的蛋白质结构→推测应有的氨基酸序列→找到相对应的核苷酸序列．
（4）一般来说，生态工程的主要任务是对已被破坏的生态环境（或受损的生态系统）进行修复，对造成环境污染和破坏的生产方式进行改善，并提高生态系统的生产力．
故答案为：
（1）供体器官不足    早期胚胎     核移植
（2）目的基因      抑制小型猪器官表面抗原的表达
（3）功能   结构   氨基酸
（4）生态环境（或受损的生态系统）      生产方式