优质解答
A、基因工程中最常用的载体是大肠杆菌的质粒，A正确；
B、基因工程的工具有限制酶、DNA连接酶和运载体，其中限制性核酸内切酶和DNA连接酶是两种工具酶，B正确；
C、基因工程可按照人们的意愿定向改造生物的性状，这人为地增加了生物变异的范围，实现种间遗传物质的交换，C正确；
D、基因工程的基本原理是基因重组，D错误．
故选：D．
A、基因工程中最常用的载体是大肠杆菌的质粒，A正确；
B、基因工程的工具有限制酶、DNA连接酶和运载体，其中限制性核酸内切酶和DNA连接酶是两种工具酶，B正确；
C、基因工程可按照人们的意愿定向改造生物的性状，这人为地增加了生物变异的范围，实现种间遗传物质的交换，C正确；
D、基因工程的基本原理是基因重组，D错误．
故选：D．