A、图中1和3、2和4是两对同源染色体，其中2和4是一对性染色体，A正确；
B、由以上分析可知，该细胞进行的是有丝分裂，不能发生基因重组，只能产生基因突变和染色体变异2种可遗传变异类型，B错误；
C、1和3是一对同源染色体，不能组成一个染色体组，C错误；
D、此细胞进行的是有丝分裂，不能发生交叉互换（只发生在减数分裂过程中），但染色体3的姐妹染色单体上含有等位基因A、a，其形成的原因是基因突变，D错误．
故选：A． A、图中1和3、2和4是两对同源染色体，其中2和4是一对性染色体，A正确；
B、由以上分析可知，该细胞进行的是有丝分裂，不能发生基因重组，只能产生基因突变和染色体变异2种可遗传变异类型，B错误；
C、1和3是一对同源染色体，不能组成一个染色体组，C错误；
D、此细胞进行的是有丝分裂，不能发生交叉互换（只发生在减数分裂过程中），但染色体3的姐妹染色单体上含有等位基因A、a，其形成的原因是基因突变，D错误．
故选：A．