A、细菌是靠分裂进行生殖的，也就是一个细菌分裂成两个细菌，真菌的繁殖方式孢子繁殖，繁殖速度快．不符合题意；
B、细菌都是单细胞个体，一个细菌就是一个细胞．真菌中既有单细胞的也有多细胞的，如酵母菌是单细胞个体，蘑菇是多细胞个体，整体包括：菌盖、菌褶、菌柄、菌丝等．符合题意；
C、在自然界中动物、植物的遗体、遗物不会永远保留着，因为细菌真菌会把动物、植物的遗体遗物分解成二氧化碳、水和无机盐等，归还土壤，供植物重新利用，它们作为分解者促进了自然界中的物质循环．不符合题意；
D、有的细菌是有害的，能使生物体致病，使物质腐烂变质，但大部分细菌是有益的，如甲烷菌可以净化污水，乳酸菌可以制作酸奶、泡菜等．病毒也是有的有益，有的有害，如感冒病毒等病原体可以使人或动物得病，有些噬菌体则是有益的，噬菌体又叫细菌病毒，它可以作为防治某些疾病的特效药，例如烧伤病人在患处涂抹绿浓杆菌噬菌体稀释液 它可以吞噬细菌．不符合题意．
故选：B A、细菌是靠分裂进行生殖的，也就是一个细菌分裂成两个细菌，真菌的繁殖方式孢子繁殖，繁殖速度快．不符合题意；
B、细菌都是单细胞个体，一个细菌就是一个细胞．真菌中既有单细胞的也有多细胞的，如酵母菌是单细胞个体，蘑菇是多细胞个体，整体包括：菌盖、菌褶、菌柄、菌丝等．符合题意；
C、在自然界中动物、植物的遗体、遗物不会永远保留着，因为细菌真菌会把动物、植物的遗体遗物分解成二氧化碳、水和无机盐等，归还土壤，供植物重新利用，它们作为分解者促进了自然界中的物质循环．不符合题意；
D、有的细菌是有害的，能使生物体致病，使物质腐烂变质，但大部分细菌是有益的，如甲烷菌可以净化污水，乳酸菌可以制作酸奶、泡菜等．病毒也是有的有益，有的有害，如感冒病毒等病原体可以使人或动物得病，有些噬菌体则是有益的，噬菌体又叫细菌病毒，它可以作为防治某些疾病的特效药，例如烧伤病人在患处涂抹绿浓杆菌噬菌体稀释液 它可以吞噬细菌．不符合题意．
故选：B