A、叶绿体是绿色的，不需染色，并且菠菜叶片下表皮保卫细胞含有叶绿体，因此在显微镜下可以看到菠菜叶片下表皮保卫细胞中具有多个叶绿体，故A正确；
B、花生子叶细胞需要用苏丹Ⅲ染色后才能观察到存在多个橘黄色脂肪颗粒，故B错误；
C、线粒体需要用健那绿染色后才能在显微镜下观察到，故C错误；
D、紫色洋葱鳞片叶外表皮细胞中有紫色的大液泡，因此细胞核观察并不清晰，故D错误．
故选A． A、叶绿体是绿色的，不需染色，并且菠菜叶片下表皮保卫细胞含有叶绿体，因此在显微镜下可以看到菠菜叶片下表皮保卫细胞中具有多个叶绿体，故A正确；
B、花生子叶细胞需要用苏丹Ⅲ染色后才能观察到存在多个橘黄色脂肪颗粒，故B错误；
C、线粒体需要用健那绿染色后才能在显微镜下观察到，故C错误；
D、紫色洋葱鳞片叶外表皮细胞中有紫色的大液泡，因此细胞核观察并不清晰，故D错误．
故选A．